規劃處:負責擬定國家哲學社會科學研究中長期規劃和年度計劃﹔調整增補學科規劃評審小組專家﹔擬定和發布國家社科基金年度項目課題指南﹔組織年度課題申報和評審立項﹔組織實施和管理國家社科基金重大項目(基礎研究類、跨學科類)和委托研究項目。
基金處:負責國家社科基金項目經費撥款﹔負責社科基金項目經費管理和監督﹔組織實施和管理國家社科基金重大項目(應用研究類)和西部項目。
成果處:負責國家社科基金項目中期管理和最終成果的鑒定驗收與結項﹔負責組織和編發《成果要報》﹔組織實施學術期刊資助和管理﹔組織社科基金項目成果評獎。
智庫聯絡處:負責國家高端智庫建設規劃和實施,組織高端智庫申報、評估和日常管理,開展國內外智庫發展動態的調查研究,為中央決策提供咨詢服務﹔組織評審國家社科基金后期資助項目和中華學術外譯項目。
宣傳處:負責國家社科基金和社科規劃管理工作的日常宣傳﹔負責主編“國家社科基金”專刊、專欄﹔負責管理全國社科規劃辦網站﹔組織評審《國家哲學社會科學成果文庫》。
綜合處:全國社會科學規劃辦公室內設的綜合職能部門,主要負責日常文秘、行政管理、財務會計、會議組織、網絡服務、內外聯絡、后勤保障工作等。